El esquema adjunto, expresa las distintas operaciones de gestión de los aparatos que contienen PCB en las correspondientes plantas de tratamiento. Una vez que el aparato con PCB llega a la Planta de Tratamiento, se le extrae los líquidos con PCB que contienen y el aparato es sometido a un proceso de descontaminación y posteriormente a su despiece y fragmentación, separando los líquidos de los sólidos, y éstos a su vez se separan en sólidos metálicos y otros restos descontaminados. Cada una de estas partes es tratada de forma diferente conforme a lo que expresa el esquema.
Los líquidos generalmente se incineran, pero la Directiva y el Real Decreto establecen otras formas de eliminación de PCB, como el almacenamiento permanente profundo y bajo tierra.