Coincidiendo con la celebración de las Reuniones Plenarias, el Secretariado de la RAA organiza encuentros monográficos de puertas abiertas, que cuentan con la participación de expertos en un tema ambiental concreto de actualidad y de especial incidencia en el territorio donde se llevan a cabo estos encuentros; y paralelamente se expone por parte de responsables en la gestión de Fondos europeos, la posible contribución de los diferentes Fondos en la solución de dicho problema.
Las jornadas cuentan también con representantes de la Comisión competentes en políticas ambientales y de gestión de Fondos.
Desde 1998 hasta la actualidad se han celebrado 43 Jornadas Temáticas en diversos puntos de la geografía española, siempre en colaboración con la autoridad ambiental de la Comunidad Autónoma anfitriona.
Algunas de las temáticas abordadas han sido:
Adaptación al Cambio Climático
Restauración de espacios degradados
Gestión de los recursos hídricos
Coexistencia de humanos con especies silvestres
Infraestructuras verdes
Economía circular
XLIV Jornada Temática: Efectos del cambio climático sobre los recursos hídricos: sequías e inundaciones
XLIII Jornada Temática: La gestión sostenible de los recursos hídricos y Fondos europeos
XLII Jornada Temática: Recuperación de espacios degradados y la contribución de los Fondos europeos
XLI Jornada Temática: Coexistencia del ser humano y las especies silvestres: interacción, conflictos actuales, retos y soluciones
XL Jornada Temática: Los desafíos en la adaptación al cambio climático
XXXIX Jornada Temática: Medio marino y residuos y Fondos europeos
XXXVIII Jornada Temática: Infraestructuras verdes
XXXVII Jornada Temática: Economía Circular
XXXVI Jornada Temática: Actuaciones urbanas para una Economía Baja en Carbono
XXXV Jornada Temática: Enfoque integrado de los Fondos Estructurales y de Inversión Europeos
XXXIV Jornada Temática: Dimensión ambiental de la Política de Desarrollo Rural 2014-2020
XXXIII Jornada Temática: Los Fondos europeos 2014-2020 como oportunidad de financiación para empresas en el sector ambiental
XXXII Jornada Temática: La Ecoinnovación en los Fondos europeos 2014-2020
XXXI Jornada Temática: El cambio climático en los Fondos Comunitarios
XXX Jornada Temática: Información, participación y responsabilidad ambiental
XXIX Jornada Temática: La Red Natura 2000 en el marco del nuevo periodo de programación 2007-2013 y su contribución al desarrollo sostenible
XXVIII Jornada Temática: Financiación europea, innovación tecnológica y la participación ciudadana en las políticas del agua: una visión para el siglo XXI
XXVII Jornada Temática: Fondos Comunitarios 2007 - 2013
XXVI Jornada Temática: Desarrollo Rural Sostenible y Fondos europeos
XXV Jornada Temática: I+D+i y los Fondos Comunitarios 2007 - 2013
XXIV Jornada Temática: Evaluación Ambiental Estratégica y Fondos Comunitarios 2007-2013
XXIII Jornada Temática: Desarrollo Sostenible y Medio Ambiente y Fondos Comunitarios 2007-2013
XXII Jornada Temática: Plan Nacional de Asignación de Derechos de Emisión y el Cambio Climático
XXI Jornada Temática: Medio marino
XX Jornada Temática: Reforma de la PAC y Medio Ambiente
XIX Jornada Temática: Cooperación al Desarrollo y Medio Ambiente
XVIII Jornada Temática: Protección del Suelo y Fondos europeos
XVII Jornada Temática: Medio Ambiente y Pymes en el marco de los Fondos estructurales
XVI Jornada Temática: Programa LIFE y Fondos estructurales
XV Jornada Temática: Impacto ambiental y Fondos europeos
XIV Jornada Temática: Ordenación del Territorio y Medio Ambiente
XIII Jornada Temática: Red Natura 2000 y Fondos europeos
XII Jornada Temática: Gestión de Residuos y Fondos europeos
XI Jornada Temática: Gestión sostenible del agua y Fondos europeos
X Jornada Temática: Turismo, medio ambiente y Fondos europeos
IX Jornada Temática: Medio ambiente urbano y Fondos europeos
VIII Jornada Temática: Integración del medio ambiente en el sector de transportes y Fondos europeos
VII Jornada Temática: Integración del medio ambiente en el sector de la industria y Fondos europeos
VI Jornada Temática: Integración del medio ambiente en el sector de la pesca y Fondos europeos
V Jornada Temática: Fondo Social Europeo y medio ambiente
IV Jornada Temática: Integración del medio ambiente en el sector de la energía y Fondos europeos
III Jornada Temática: Integración del medio ambiente en el sector de la agricultura y Fondos europeos
II Jornada Temática: Evaluación de las incidencias ambientales de los proyectos financiados con Fondos Estructurales. El Fondo de Cohesión
I Jornada Temática: Los Fondos Estructurales, el Fondo de Cohesión y el medio ambiente