La RNF Tramo Medio de la Riera de Osor transcurre en gran parte en el espacio de la Red Natura 2000 Les Guilleries (LIC ES5120012). El río es de régimen permanente y discurre por una zona completamente forestada con un valle muy cerrado, con vertientes muy pronunciadas que se asemejan a un desfiladero. Por esta razón, la franja de vegetación de ribera existente, constituida por una aliseda, presenta una anchura mínima. Esta formación forestal, caracterizada por la dominancia del aliso (Alnus glutinosa) y acompañada por el fresno (Fraxinus excelsior), presenta en esta zona especies propias de los ambientes forestales del entorno, como el roble (Quercus humilis) o el avellano (Corylus avellana). Hay que destacar además la presencia de especies vegetales de interés por ser consideradas raras en Cataluña, como son la Alliaria petiolata, Aster pilosus o Laurus nobilis.
Las presiones e impactos presentes (presencia de especies vegetales invasoras -Buddleja davidii- y trazas de contaminación por aguas residuales urbanas) no son de gran magnitud, siendo bueno el estado de conservación general de la reserva.