Los Estanys de la Gotina son un conjunto de 4 estanques de tamaños e hidroperíodos muy diferenciados. Forman parte del complejo sistema de estanques y prados húmedos al pie del monte de l’Albera, cuyas aguas afloran por fisuras y fallas locales del sustrato granítico de la zona, procedentes de infiltraciones ocurridas en las partes altas del macizo. Parte del agua también puede provenir de escorrentías superficiales. Por norma general, las lagunas se llenan con las lluvias de otoño y permanecen llenas hasta bien entrada la primavera, exceptuando años poco lluviosos en los que algunos de los estanques pueden no llegar a llenarse. En el entorno se puede encontrar un complejo megalítico prehistórico.
Los Estanys de la Gotina se encuentran en una zona de producción vitivinícola, aunque la vegetación del entorno está formada por matorrales de estepas (Cistus sp.), brezos (Erica sp.) y alcornoques (Quercus suber) dispersos. El valor de estos estanques radica en su funcionamiento hidrogeológico (estanques temporales) y, sobre todo, en la flora hidrófita que albergan. Destaca la presencia de Marsilea strigosa, diversas especies de isoetes (Isoetes sp.), y plantas como Elatine brochonii, Polygonum amphibium, Myriophyllum alterniflorum, Alisma plantago-aquatica, Baldellia ranunculoides, Juncus heterophyllus o Eleocharis palustris, entre otras.
En el espacio se ha identificado la presencia de varios Hábitats de Interés Comunitario (HIC), destacando el 3120, correspondiente a aguas estancadas oligotróficas muy poco mineralizadas con Isoetes spp. en terrenos generalmente arenosos de la Mediterránea occidental; el 3130, correspondiente a aguas estancadas poco o muy mesotróficas con vegetación de las clases Littorelletea uniflorae y/o Isoeto-Nanojuncetea; y el 3170*, HIC prioritario, correspondiente a lagunas y balsas temporales mediterráneas.
A nivel faunístico, los Estanys de la Gotina cuentan con una gran riqueza de especies propias de zonas húmedas. Destacan anfibios como el sapo de espuelas (Pelobates cultripes), el tritón jaspeado (Triturus marmoratus), la ranita de puntos (Pelodytes punctatus) o el sapo corredor (Epidalea calamita), especies típicas de estanques temporales mediterráneos, y más de 60 taxones diferentes de invertebrados acuáticos, como crustáceos branquiópodos y copépodos, insectos coleópteros, dípteros y odonatos, entre otros. En momentos de inundación también se pueden observar galápagos leprosos (Mauremys leprosa). Cabe destacar la presencia de la tortuga mediterránea (Testudo hermanni) en las proximidades de los estanques. Ornitológicamente, los Estanys de la Gotina (igual que otros estanques de l’Albera) son un punto importante de parada durante las rutas migratorias, especialmente durante los días de tramontana, además de formar parte de la zona de campeo de diversas especies de interés comunitario incluidas en el Anexo I de la Directiva Aves (2009/147/CE). Destacan la cigüeña blanca (Ciconia ciconia), el águila calzada (Aquila fasciata) y el aguilucho cenizo (Circus pygargus).
En el entorno de los estanques se encuentran rutas señalizadas para descubrir los estanques y el complejo megalítico de la zona.