La cabecera del río Altube es un ejemplo representativo de los pequeños ejes fluviales cántabro-atlánticos calcáreos pertenecientes a la demarcación hidrográfica del Cantábrico Oriental de la Provincia de Álava.
El régimen hidrológico es pluvio-nival de carácter estacional, y conserva plenamente sus características naturales.
El río, discurre a través de un valle modelado sobre calizas, margas, arenas y arcillas, configurando una llanura de inundación estrecha y discontinua, con un trazado sinuoso. Los grandes bloques y cantos del lecho condicionan la estructura longitudinal del cauce configurando rápidos y remansos o pequeños saltos y pozas.
La vegetación de ribera está constituida por bandas arbustivas con taxones característicos de la mimbrera calcófila pirenaicocantábrica, en estrecho contacto con el hayedo circundante.
El tramo y su entorno constituyen una zona de gran valor natural y paisajístico, consecuencia del equilibrio en la dinámica de los procesos fluviales.